Ajakirja Eesti Loodus toimetus valis 2012. aasta puuks õunapuu. Eesti Loodus plaanib aasta jooksul tutvustada õunapuude eri liike.
Eesti pärismaine õunapuuliik on mets-õunapuu, mis on looduskaitse all.
Pomoloog Kalju Kase järgi kasvas mets-õunapuu puu meil vanasti looduslikult igal pool, tänapäeval võib teda kohata peamiselt Lääne-Eesti saartel. Teede äärde rajatud alleedes kasvavad enamasti aed-õunapuud.
Aasta puud on Eestis 1996–2011 olnud kadakas, kuusk, tamm, kask, pihlakas, mänd, pärn, vaher, lepp, haab, paju, saar, jugapuu, sarapuu, toomingas, jalakas ja künnapuu.